המינהל לסחר חוץ אחראי על גיבוש וקידום מדיניות סחר החוץ של ישראל, במטרה להגביר התחרותיות של המשק הישראלי בשווקים הבינ"ל. למטרה זאת פועל המינהל בתחומים הבאים:

תיאום פעילות הגופים במערך סחר החוץ הציבורי העוסקים בקידום הסחר, שת"פ והשקעות,

הפעלת מערך בן 37 נספחים מסחריים הפועלים ב- 40 ארצות המהוות את מרכזי הסחר העולמיים ויעדי היצוא העיקריים של ישראל.

קביעת הנחיות לתוכנית עבודה המתואמת בין ארגונים אלו ומערך הנציגויות המסחריות בחו"ל,

הכשרת הנציגים הכלכליים של ישראל העוסקים בקידום הקשרים הכלכליים – מסחריים הבינמדינתיים ויצירת הזדמנויות לשת"פ כלכליים בין ישראל ושותפות הסחר וכן טיפול בהיבטים השונים של מדיניות סחר חוץ.

בחינת כדאיות הסכמי סחר חדשים, יזום וניהול מו"מ על הסכמי סחר חדשים, תחזוק הסכמים, וכן ניהול מחלוקות סחר למול ממשלות זרות.

ייצוג ישראל בארגון הסחר העולמי, גיבוש וקביעת מדיניות ישראל בארגון וייצוג המדינה בסבבי הסחר העולמיים המתנהלים במסגרת הארגון.

חקירת תלונות של יצרנים מקומיים על יבוא בהיצף או יבוא במחיר נתמך (סובסידיות זרות) בהתאם לסמכות המוקנה על פי חוק היטלי סחר , התשנ"א 1991.

בנוסף עוסק המינהל בקידום השקעות זרות בישראל ויצירת שיתופי פעולה תעשייתיים בין חברות זרות וחברות ישראליות וזאת באמצעות, זיהוי חברות יעד להשקעה בישראל, הגדרה ותעדוף תחומי פעילות להשקעה בישראל, הקמת תשתיות הסברתיות לקידום סחר והשקעות, בניית רשת קשרים ומאגרי מידע, הכנת תיקי משקיעים וארגון סמינרים וכנסים.